Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SARDHQ9UL12 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SARDHQ9UL12 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SARDHQ9UL12 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SARDHQ9UL12 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SARDHQ9UL12 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms