Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX7

NUP50, Nuclear pore complex protein Nup50, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50Q9UKX7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP50Q9UKX7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP50Q9UKX7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP50Q9UKX7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms