Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV3

ACIN1, Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACIN1Q9UKV3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
ACIN1Q9UKV3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ACIN1Q9UKV3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ACIN1Q9UKV3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ACIN1Q9UKV3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
ACIN1Q9UKV3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ACIN1Q9UKV3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ACIN1Q9UKV3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ACIN1Q9UKV3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ACIN1Q9UKV3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ACIN1Q9UKV3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ACIN1Q9UKV3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ACIN1Q9UKV3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ACIN1Q9UKV3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ACIN1Q9UKV3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ACIN1Q9UKV3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
ACIN1Q9UKV3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ACIN1Q9UKV3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ACIN1Q9UKV3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ACIN1Q9UKV3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ACIN1Q9UKV3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ACIN1Q9UKV3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ACIN1Q9UKV3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
ACIN1Q9UKV3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ACIN1Q9UKV3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ACIN1Q9UKV3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ACIN1Q9UKV3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ACIN1Q9UKV3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ACIN1Q9UKV3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ACIN1Q9UKV3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ACIN1Q9UKV3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ACIN1Q9UKV3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ACIN1Q9UKV3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ACIN1Q9UKV3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms