Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRDM4Q9UKN5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM4Q9UKN5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRDM4Q9UKN5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM4Q9UKN5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM4Q9UKN5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms