Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3BQ9UH17 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APOBEC3BQ9UH17 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBEC3BQ9UH17 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBEC3BQ9UH17 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms