Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGGBP1Q9UFW8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGGBP1Q9UFW8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CGGBP1Q9UFW8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms