Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APEX2Q9UBZ4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APEX2Q9UBZ4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
APEX2Q9UBZ4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APEX2Q9UBZ4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APEX2Q9UBZ4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms