Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTRRQ9UBK8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MTRRQ9UBK8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTRRQ9UBK8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MTRRQ9UBK8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTRRQ9UBK8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTRRQ9UBK8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MTRRQ9UBK8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTRRQ9UBK8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MTRRQ9UBK8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTRRQ9UBK8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTRRQ9UBK8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTRRQ9UBK8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MTRRQ9UBK8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTRRQ9UBK8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MTRRQ9UBK8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MTRRQ9UBK8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MTRRQ9UBK8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MTRRQ9UBK8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MTRRQ9UBK8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms