Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGFRNQ9P2B2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGFRNQ9P2B2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGFRNQ9P2B2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms