Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EHD3Q9NZN3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD3Q9NZN3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EHD3Q9NZN3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EHD3Q9NZN3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms