Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIN1Q9NXP7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIN1Q9NXP7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIN1Q9NXP7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIN1Q9NXP7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms