Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MED9Q9NWA0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED9Q9NWA0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED9Q9NWA0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms