Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TCP11L1Q9NUJ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TCP11L1Q9NUJ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TCP11L1Q9NUJ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TCP11L1Q9NUJ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TCP11L1Q9NUJ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms