Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A13Q9NSD5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC6A13Q9NSD5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A13Q9NSD5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC6A13Q9NSD5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms