Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GKN1Q9NS71 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GKN1Q9NS71 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GKN1Q9NS71 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms