Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHAF3Q9NRP4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHAF3Q9NRP4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SDHAF3Q9NRP4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAF3Q9NRP4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.1 ms