Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHB16Q9NRJ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHB16Q9NRJ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDHB16Q9NRJ7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHB16Q9NRJ7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHB16Q9NRJ7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCDHB16Q9NRJ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms