Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DMRT3Q9NQL9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DMRT3Q9NQL9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DMRT3Q9NQL9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DMRT3Q9NQL9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DMRT3Q9NQL9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DMRT3Q9NQL9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DMRT3Q9NQL9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DMRT3Q9NQL9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DMRT3Q9NQL9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DMRT3Q9NQL9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DMRT3Q9NQL9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DMRT3Q9NQL9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DMRT3Q9NQL9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DMRT3Q9NQL9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DMRT3Q9NQL9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DMRT3Q9NQL9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DMRT3Q9NQL9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DMRT3Q9NQL9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DMRT3Q9NQL9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DMRT3Q9NQL9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DMRT3Q9NQL9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DMRT3Q9NQL9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DMRT3Q9NQL9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DMRT3Q9NQL9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DMRT3Q9NQL9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DMRT3Q9NQL9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DMRT3Q9NQL9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DMRT3Q9NQL9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DMRT3Q9NQL9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DMRT3Q9NQL9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms