Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CYLDQ9NQC7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CYLDQ9NQC7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYLDQ9NQC7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYLDQ9NQC7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYLDQ9NQC7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms