Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRD7Q9NPI1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRD7Q9NPI1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BRD7Q9NPI1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD7Q9NPI1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms