Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM138Q9NPI0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM138Q9NPI0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM138Q9NPI0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms