Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB18Q9NP72 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB18Q9NP72 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB18Q9NP72 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB18Q9NP72 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB18Q9NP72 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB18Q9NP72 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB18Q9NP72 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB18Q9NP72 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB18Q9NP72 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms