Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUFT1Q9NNX1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUFT1Q9NNX1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUFT1Q9NNX1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TUFT1Q9NNX1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUFT1Q9NNX1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms