Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX3

ZNF304, Zinc finger protein 304, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF304Q9HCX3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF304Q9HCX3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF304Q9HCX3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF304Q9HCX3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF304Q9HCX3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF304Q9HCX3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms