Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SCAF1Q9H7N4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SCAF1Q9H7N4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SCAF1Q9H7N4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SCAF1Q9H7N4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SCAF1Q9H7N4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SCAF1Q9H7N4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SCAF1Q9H7N4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
SCAF1Q9H7N4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SCAF1Q9H7N4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SCAF1Q9H7N4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SCAF1Q9H7N4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SCAF1Q9H7N4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SCAF1Q9H7N4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SCAF1Q9H7N4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SCAF1Q9H7N4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SCAF1Q9H7N4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SCAF1Q9H7N4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SCAF1Q9H7N4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SCAF1Q9H7N4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SCAF1Q9H7N4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SCAF1Q9H7N4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms