Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C8orf33Q9H7E9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C8orf33Q9H7E9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C8orf33Q9H7E9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C8orf33Q9H7E9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.8 ms