Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEMA6CQ9H3T2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA6CQ9H3T2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6CQ9H3T2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6CQ9H3T2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms