Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC68Q9H2F9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC68Q9H2F9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC68Q9H2F9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC68Q9H2F9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms