Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C1

ZMYND12, Zinc finger MYND domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND12Q9H0C1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZMYND12Q9H0C1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZMYND12Q9H0C1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZMYND12Q9H0C1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZMYND12Q9H0C1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZMYND12Q9H0C1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZMYND12Q9H0C1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZMYND12Q9H0C1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZMYND12Q9H0C1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZMYND12Q9H0C1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZMYND12Q9H0C1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZMYND12Q9H0C1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZMYND12Q9H0C1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZMYND12Q9H0C1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZMYND12Q9H0C1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ZMYND12Q9H0C1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZMYND12Q9H0C1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZMYND12Q9H0C1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms