Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP44Q9C0F1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP44Q9C0F1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP44Q9C0F1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP44Q9C0F1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP44Q9C0F1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP44Q9C0F1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEP44Q9C0F1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP44Q9C0F1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP44Q9C0F1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEP44Q9C0F1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP44Q9C0F1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CEP44Q9C0F1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP44Q9C0F1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP44Q9C0F1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP44Q9C0F1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP44Q9C0F1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP44Q9C0F1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP44Q9C0F1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP44Q9C0F1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP44Q9C0F1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP44Q9C0F1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP44Q9C0F1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP44Q9C0F1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP44Q9C0F1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP44Q9C0F1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP44Q9C0F1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP44Q9C0F1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEP44Q9C0F1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP44Q9C0F1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms