Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM4Q9C037 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM4Q9C037 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM4Q9C037 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms