Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFIH1Q9BYX4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFIH1Q9BYX4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
IFIH1Q9BYX4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIH1Q9BYX4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFIH1Q9BYX4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.9 ms