Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LGR4Q9BXB1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LGR4Q9BXB1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LGR4Q9BXB1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGR4Q9BXB1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGR4Q9BXB1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms