Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SALL3Q9BXA9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SALL3Q9BXA9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SALL3Q9BXA9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SALL3Q9BXA9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SALL3Q9BXA9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SALL3Q9BXA9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SALL3Q9BXA9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SALL3Q9BXA9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SALL3Q9BXA9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SALL3Q9BXA9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SALL3Q9BXA9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SALL3Q9BXA9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SALL3Q9BXA9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SALL3Q9BXA9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SALL3Q9BXA9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SALL3Q9BXA9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SALL3Q9BXA9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SALL3Q9BXA9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SALL3Q9BXA9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms