Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAIPQ9BWF2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAIPQ9BWF2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRAIPQ9BWF2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAIPQ9BWF2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms