Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SHANK2-AS3Q9BTD1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms