Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYT3Q9BQG1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYT3Q9BQG1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYT3Q9BQG1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms