Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPAS1Q99742 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPAS1Q99742 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPAS1Q99742 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPAS1Q99742 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms