Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SIGMAR1Q99720 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIGMAR1Q99720 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SIGMAR1Q99720 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SIGMAR1Q99720 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms