Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SRPK1Q96SB4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRPK1Q96SB4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRPK1Q96SB4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SRPK1Q96SB4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms