Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CICQ96RK0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CICQ96RK0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CICQ96RK0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CICQ96RK0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CICQ96RK0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CICQ96RK0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CICQ96RK0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CICQ96RK0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CICQ96RK0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CICQ96RK0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CICQ96RK0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CICQ96RK0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CICQ96RK0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CICQ96RK0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CICQ96RK0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CICQ96RK0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CICQ96RK0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CICQ96RK0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CICQ96RK0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CICQ96RK0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CICQ96RK0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CICQ96RK0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CICQ96RK0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CICQ96RK0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms