Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC85AQ96PX6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC85AQ96PX6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC85AQ96PX6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC85AQ96PX6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms