Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP5Q96PP8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GBP5Q96PP8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GBP5Q96PP8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GBP5Q96PP8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms