Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF145Q96MT1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RNF145Q96MT1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF145Q96MT1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RNF145Q96MT1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms