Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF560Q96MR9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF560Q96MR9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF560Q96MR9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF560Q96MR9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZNF560Q96MR9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZNF560Q96MR9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF560Q96MR9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF560Q96MR9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF560Q96MR9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF560Q96MR9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF560Q96MR9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms