Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNX27Q96L92 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNX27Q96L92 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SNX27Q96L92 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms