Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKNOX2Q96KN3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKNOX2Q96KN3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PKNOX2Q96KN3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms