Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMARCD1Q96GM5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMARCD1Q96GM5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMARCD1Q96GM5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCD1Q96GM5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms