Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTUB1Q96FW1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTUB1Q96FW1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms