Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NEIL1Q96FI4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NEIL1Q96FI4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NEIL1Q96FI4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms